生物物理I(温泉) 2017秋 2016秋  课程号:203005
2017秋 2016秋  课程号:203005
7.8(4人评价)
  • 课程难度:中等
  • 作业多少:中等
  • 给分好坏:一般
  • 收获大小:一般
选课类别:未知 教学类型:未知
课程类别:本科计划内课程 开课单位:物理学院
课程层次:未知 学分:2
课程主页:暂无(如果你知道,劳烦告诉我们!)
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今天在家里闲来无事看动力学系统,又想到了这门课。可能跟大多数同学的认知不同,我对这门课程的总体印象并不好。从这门课本身来看,内容丰富,深入浅出,而且跟传统的生物课程有挺大差别,的确是一门计算生物学的优秀课程。但是作为一个已经毕业的科大学生,我还是想从更宏观一点的角度来点评一下这门课。
首先,计算神经科学与生物物理学之间的差别确实挺大。这门课程的核心之一,dynamic system,动力学系统,也是计算神经的核心,然而在生物物理中几乎用不到。以计算神经作为生物物理的开篇课,未免有些以偏概全(这里我还是推荐大二大三的同学,想要接触生物物理的话首先去选袁军华老师的课,虽然袁老师的课程质量一般,但还是最为正宗的生物物理的思想)。
回到dynamic system,动力学系统的入门还是较困难的,需要对常微分有一定的理解,不然只会照葫芦画瓢。比价可惜的是科大的好像并未开设有关动力学的什么优质课程,b站上面也挺难找得到。温老师在上课时,几乎最多只提到了相图和不动点的概念,然而还是仅仅介绍了理论本身,对于理论的必要背景和证明几乎没有做任何阐述,所以这门课上教授的知识几乎仅足够把作业完成,个人并不认为这样的知识对于以后的研究工作超过课程本身的帮助。
这门课对于初学者还是比较难的,但是难点在于英语授课以及涵盖的知识面的广度,对于某一方面的介绍都是浅尝辄止,对于想要做任何深入了解的同学,温老师正在用的教材“Theoretical Neuroscience”虽然浅显且经典但知识体系还是过于陈旧且基础,几乎已经是上个世纪的内容了(虽然计算神经近年来也没多少发展就是了)。这里我倒是推荐“神经科学的数学模拟”以及上面同学推荐的那本Dynamical System in Neuroscience,很适合想要做任何更深一步了解的同学。
最后回到这门课的内容。对于初学者而言,这样一种生物系统的量化描述是非常attractive的,然而对于任何一种提出的模型,我们都应该去思考它的合理性,以及在生物系统中的实际存在,这也就是为什么一个物理模型相较于数学模型在计算生物学中往往会有更好的表现。数学模型和实际的关系并不等同于数学发展和物理的关系。以动力学系统为主导的数学模型核心就是pde和ode,这是交给数学系干的事(事实上绝大多数动力学系统的神经科学都由数学专业的小组在做),而且现在关于动力学系统主导的计算神经,在很多意义上都已经过时了。此外,温老师的很多想法与美国中产以上阶层的想法很像,关于他其他的一些私事在此也不便多说,总感觉会有一股小布尔乔亚的味道,这可能也是我在很多想法上与他不合的一个主要因素。所以,上述说法仅提供一个小小的参考,总体上还是很推荐大家选的,但是评课的分数不可能是10分,我给的分数虽然很低,但也只是把它放到一个较为客观的分数而已。

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crowy 2017秋

温泉老师,人长得帅,英文棒,讲课又好♪(^∇^*)

这门课主要讲计算神经,老师带着我们模拟了挺多有趣的model~作业非常有意思(也非常难),基本上是推导公式或者在matlab上模拟什么东西。我那年没有期末考试,分全由作业决定。

这门课是生物物理系的专业课,我是头铁才选的...感觉我好像缺了某些应该提前修的数学课。但事实证明(1)温泉老师的课讲得好,易懂(2)数分上完的我勉强能处理作业...(虽然过程中我可能确实去自学了什么东西)。这门课反正对我是有点难,好几次作业都在打出GG的边缘试探...但最后做出来会特别有成就感!!!

这是我最喜欢也是最有收获的一门课,个人觉得远胜生院其他专业课。课程内容本身设计的很好:言之有物,不是浮在表面科普,也不是埋头证明公式完全不管有没有biological meaning。老师总是以生物现象入手,再讲如何模拟,最后回归生物现象。作业也和课程内容相辅相成,既帮助回忆课上的内容,也给了可以自己探索的东西。

p.s. 作为一个饱受摧残的生物狗,我第一次发现生物学还是能讲点道理的2333

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求根问底温老师讲数学的确深入浅出

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荀徐郭许 2017秋

可能是大三上我唯一到课听课的一门课了(

这门课主题是Computational Neuroscience,从各种各样的数学模型出发分析神经元活动,其中大量运用了动力系统中的处理手段,因而强烈建议修这门课时看一看老师推荐的Dynamical System in Neuroscience。最后几节课会讲述一些理论人工智能的知识,据温老师说他以后也会把这门课放到信院开。

作业是5次大作业,有一说一比较难,也有很多Bonus Credit,每一次我基本都是压ddl交的。最后给分据说是按5次大作业总分排名给出最后分数,非常Nice。强烈建议非生物物理专业的同学也可以来修该课。

虚假的计算物理A(指丁老怪

真实的计算物理A(指生物物理I

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阿诺尔德的猫膜满分o(

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hwq1221 2017秋

作业占总评的70%,期末考试是带回去写的,形式虽然是考试,内容实际相当于一次作业。学的非常轻松,不需要复习,只需要听课。

老师会经常请校外教授或研究所教授来做讲座,用英文讲课,很推荐。

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温泉

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